1、首先针对整个电池组进行充电，转灯后浮充2到3小时。假如电池组长期亏电放置，已经无法充入电量，可以直接跨过保护板充电10分钟（使用放电口充电），再正常充电即可。
2、拔下保护板的排线，拔掉之前，请做好记号，2根排线的板子，排线不可插反。测量排线上相邻针脚的电压，假如是48V的，有16个电压，60V则是20个电压。负极开始的第一串电压是从电池组负极到第一根排线之间的电压，其他以此类推。找出电压低于3.50V的单串，判断正负极，并做好标记。
3、使用3.6v的充电器，将电压低于3.50v的单串充电至3.60到3.70V。但要有人值守，严防过充电导致电池报废。
4、按照原来的顺序插回排线，注意不可反接，装好电池，即可投入使用。
最后，再教大家一些平时保养锂离子电池的方法。由于锂离子电池存在无记忆的特性，每次或者每天骑行后应及时对电池组进行有规律性的充电；假如锂电自行车放置超过两个月时间，要对电池组要进行一次彻底的充电；假如放置放超过5个月时间，要进行一次充放电循环；锂电自行车在不使用的情况下，应及时关闭电源，或把电池组从电池座上拔出另放。因为电机和控制器在空载状态下仍会消耗电源。